Isolering av genetiskt material
Extraktionsmetod
Du kan välja vilken extraktionsmetod som helst för nukleinsyror som fungerar bra med dina prover så länge slutprodukten är ren DNA eller RNA. Vår erfarenhet är att "column-based" metoder (t.ex. Qiagen RNeasy eller DNeasy) fungerar bäst för de flesta prover. För Trizol prover rekommenderar vi ett efterföljande reningssteg på en kolumn för att avlägsna förorenande ämnen. Om du vill kan vi genomföra den här reningen.
Kvantitetskrav
Det går bra att använda olika provtyper såsom FFPE, fresh-frozen eller från kultur. För optimala resultat rekommenderar vi följande minimikvantiteter nukleinsyra oavsett organism:
| Produkt | ng |
| Gene-level expression | 0.1- 250 ng |
| Transcriptome | 0.1- 250 ng |
| Cytogenetics arrays | 0.1- 250 ng |
| Copy number | 80 - 160 ng |
| Genotyping |
depends on array (please inquire) |
| miRNA | 80 -130ng |
Om dessa mängder är utmanande att uppnå med ditt nuvarande isoleringssystem finns det för de flesta analyser alternativa protokoll så att de kan köras framgångsrikt med mindre material. Tveka inte att kontakta oss för alternativa och speciella protokoll!
Kvalitetskrav
Integriteten hos ditt utgångsmaterial är av avgörande betydelse, särskilt om det finns tecken på kemisk kontaminering eller nedbrytning av materialet. Kom ihåg att mäta dina prover med Nanodrop för att bedöma risken för kontaminering i provet. Dessutom, särskilt för FFPE-härledda sampel, föreslår vi att du kör några nyckelprover på en gel för att säkerställa integritet. Ofta kan dubbelsträngat DNA krävas och då föreslår vi en Qubit-körning. Om du vill kan vi tillhandahålla Qubit och BioAnalyzer analys för dina projekt.